Orchestre National Bordeaux Aquitaine (Национальный оркестр Аквитании) основали в 1940 году под названием Orchestre Philharmonique de Bordeaux (Филармонический оркестр Бордо). Первые выступления проходили в Grand Théâtre de Bordeaux под управлением таких дирижёров, как Шарль Мюнш и Жан Мартинон. В 1960-е годы оркестр получил статус национального и современное название, отражающее его принадлежность к региону Нувель-Аквитания.
Особую страницу в истории коллектива открыл период работы дирижёра Алена Ломбара (1973-1987). Под его руководством оркестр записал все симфонии Бетховена и впервые в 1982-м году гастролировал в СССР, представив в Москве и Ленинграде произведения Берлиоза и Дебюсси. Эти концерты получили восторженные отзывы советской прессы.
В 1990-х годах оркестр начал сотрудничать с российскими музыкантами. В 1995 году с коллективом выступил скрипач Виктор Третьяков, исполнивший Концерт Чайковского, а в 2003-м пианист Николай Луганский представил программу из сочинений Рахманинова. Эти концерты проходили в рамках ежегодного фестиваля в Бордо.
Среди значимых проектов — цикл «Все симфонии Малера» под управлением Квентина Лекомта. Оркестр известен новаторскими образовательными программами, включая концерты для молодёжи и выступления в городских парках Бордо.
В 2018 году музыканты оркестра установили рекорд, исполнив на фестивале в Аркашоне «Болеро» Равеля 10 раз подряд.