Марчелло Рота выучил русский язык по совету дяди — легендарного композитора Нино Роты, считавшего российских музыкантов лучшими в мире. Этот выбор определил творческую судьбу Марчелло, связав с Россией прочными музыкальными узами. Маэстро неоднократно выступал в России, включая концерты в Большом зале Московской консерватории, где исполнял музыку Нино Роты с Симфоническим оркестром радио «Орфей». В списке оркестров, которыми дирижировал Марчелло, — Большой симфонический оркестр имени Чайковского, Президентский оркестр Российской Федерации и Симфонический оркестр «Новая Россия».
Родился Марчелло в музыкальной семье. Обучался в Консерватории имени Вивальди в Алессандрии по классу валторны и в Музыкальной академии Киджи в Сиене, где его педагогами по дирижированию были Игорь Маркевич и Франко Феррара. Дирижёрский дебют состоялся за пультом Национального симфонического оркестра Итальянского радио в Турине.
С 2004 года Рота — главный приглашённый дирижёр Чешского национального симфонического оркестра, с которым записал 15 CD и гастролировал за рубежом. В дискографии — сочинения Моцарта, Шумана, Дворжака, Равеля, опера «Роберто Деверё» Доницетти, а также киномузыка и симфонии Нино Роты.
В репертуаре — более 40 опер, среди которых произведения Россини, Беллини, Доницетти, Верди и Пуччини. Особое место в творчестве Роты занимает популяризация наследия его дяди, Нино Роты. Марчелло дирижировал программами, посвящёнными музыке к фильмам Феллини, Копполы и Висконти, включая легендарные саундтреки к «Крёстному отцу», «Ромео и Джульетте» и «Дороге»
Тесное творческое партнёрство связывает Марчелло Роту с тенором Андреа Бочелли — именно Рота дирижировал первым концертом тенора в 2006 году под открытым небом в амфитеатре «Театр молчания» в Лаятико. Среди других выдающихся солистов, с которыми сотрудничал маэстро, — виолончелисты Мстислав Ростропович и Давид Герингас, скрипач Дмитрий Ситковецкий, певцы Пласидо Доминго и Кири Те Канава.
«Музыка должна объединять людей, — говорит Рота. — Я мечтаю о мире и надеюсь, что мои концерты помогают людям почувствовать эту связь».